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学校创办于1934年，时名湖南国医专科学校，1960年改办为普通高等本科学校湖南中医学院，2002年湖南省中医药研究院与湖南中医学院合并，2006年经教育部批准更名为湖南中医药大学。目前，湖南中医药大学与湖南省中医药研究院实行校院合一的管理体制。
学校本部有含浦、东塘校区2个校区，总占地面积1271亩，校舍建筑面积40万平方米，图书馆藏书100万册，孤珍本古籍2万余册，有教学科研仪器设备总值1.4亿元。拥有多媒体教室160间，有医学基础、临床技能、药学基础、药学技能和综合信息5大教学实验中心。建成了先进的校园网络和多媒体教学、教室监控、教学广播、会议视频、屏蔽系统。
学校下设12个学院、1个独立学院、3个部、10个研究所、7个中心、1个图书馆、11所附属医院、2个校办合资企业。现有全日制在校学生16179人(含湘杏学院4719人)，其中硕士、博士研究生1631人。有成人教育学生6068人。
学校锻造了一支结构合理、素质高、富有创新精神的师资队伍。现有专任教师700人，其中具有正、副高级专业技术职务人员408人。有博士生导师53人、硕士生导师274人。有国家有突出贡献的中青年专家4人，享受政府特殊津贴的专家53人，国家级、省级名医、名师54人。
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