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2013年1月10日，记者从南科大安徽招生组了解到，今年南科大计划在安徽省招收25人，比去年招生计划增加5人，如果生源好的话，还会考虑动用机动指标，可能会招30人。
2013年南科大自主选拔招生继续采取“6 + 3 + 1”的办法，即高考成绩占60%，南科大组织的能力测试成绩占30%，高中阶段平时成绩占10%，最终构成考生的综合成绩来择优录取。
南科大招生报名时间为1月15日至2月5日，采取中学推荐和学生自荐两种方式。报名时，学生还必须提交不少于一千字的个人陈述一份，讲述自己的简历、兴趣爱好、志向和怎样做一个对社会有益的人。报名结束后，南科大将组织专家组对考生的申请材料进行初审，并于2月26日前公布参加复试人员名单。通过初审的考生需于3月10日在合肥一中参加南科大自行组织的能力测试。
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